Μοριακή Βιολογία ΙΙ – Ομικές Τεχνικές

Γενικά

• Κωδικός: TABO-97-Θ7
• Εξάμηνο: 9ο
• Επίπεδο Σπουδών: Προπτυχιακό
• Τύπος μαθήματος: Ανάπτυξη Δεξιοτήτων
• Γλώσσα διδασκαλίας και εξετάσεων: Ελληνικά (Αγγλικά για τους φοιτητές Erasmus)
• Το μάθημα διατίθεται σε φοιτητές Erasmus
• Μέθοδοι Διδασκαλίας (Ώρες/εβδ.): Διαλέξεις (3)
• Μονάδες ECTS: 4
• Πρόγραμμα Μαθημάτων:
  • Τε 15:00 - 18:00:

Περιεχόμενα μαθήματος

• Εισαγωγή στα βασικά εργαλεία της τεχνολογίας ανασυνδυασμένου DNA( Ενδονουκλεάσες περιορισμού και τροποιητικά ένζυμα (τάξεις, ονοματολογία, θέσεις αναγνώρισης).
• Αρχές και συστήματα κλωνοποίησης (πλασμίδια, βακτηριοφάγοι, κοσμίδια, ΒACs, YACs) Απομόνωση νουκλεινικών οξέων και μέθοδοι ανάλυσης (μέθοδοι απομόνωσης DNA και RNA, πηκτή αγαρόζης/ πολυακρυλαμίδης, μέθοδοι αποτύπωσης -Southern, Northern- και αρχές υβριδισμού).
• Γονιδιωματικές και cDNA βιβλιοθήκες (κατασκευή , έλεγχος και ανάλυση κλώνων).
• Γονιδιωματικές προσεγγίσεις ευρείας κλίμακας (Μέθοδοι αλληλούχισης του DNA αλληλούχιση τυχαίας προσπέλασης, αλληλούχιση ζευγαρωτών άκρων, α΄΄ηλούχιση επόμενης γενιάς –NGS. Μικροσυστοιχίες).
• Αλυσιδωτή αντίδραση της πολυμεράσης (PCR) ( Βασικές αρχές, εκκινητές, PCR-πραγματικού χρόνου, εφαρµογές).
• Μεταγραφομική και μεταβολομική.
• Μεταλλαξιγένεση και γονιδιακή απενεργοποίηση.
• Προκαρυωτικά-ευκαρυωτικά συστήματα έκφρασης γονιδίων.
• Επαγωγή της γονιδιακής έκφρασης (υποκινητές και δείκτες επιλογής).
• Μεταφορά DNA σε ζωικά κύτταρα (χημικές, μηχανικές φυσικές και βιολογικές μέθοδοι. Ioί και βακουλοιοί).
• Γενετική τροποποίηση ζώων (μέθοδοι παραγωγής διαγονιδιακών ποντικών, θηλαστικών και πτηνών). Μεταφορά γονιδιωμάτων (Xenopus. Μεταφορά γονιδιώματος σε ασπόνδυλα: Διαγονιδιακές μύγες. Γονιδιακή θεραπεία).
• Η παρεμβολή του RNA (RNA Interference – RNAi) και εφαρμογές της τεχνικής. Βιοεντομοκτόνα.
• Σύγκριση και ανάλυση γονιδιωμάτων ( Δημόσιες βάσεις αλληλουχιών DNA, RNA και πρωτεϊνών . Συγκριτική γονιδιωματική).

Μαθησιακοί Στόχοι

Με την επιτυχή ολοκλήρωση του μαθήματος ο φοιτητής / τρια θα:

• Έχει κατανοήσει τη συμβολή της τεχνολογίας του ανασυνδυασμένου DNA στη ραγδαία, και συνεχιζόμενη μέχρι σήμερα, πρόοδο των βιοεπιστημών.
• Έχει εξοικειωθεί με τα τεχνολογικά μοριακά εργαλεία για τη μελέτη σχεδόν οποιουδήποτε οργανισμού.
• Θα έχει χρησιμοποιήσει τις θεωρητικές του γνώσεις για να κατανοήσει τις αρχές λειτουργίας των μοριακών εργαλείων.
• έχει κατανοήσει τους τρόπους δημιουργίας μεταλλάξεων και τις επιπτώσεις τους στον οργανισμό.
• έχει αναπτύξει την κριτική και δημιουργική του σκέψη σχετικά με τη χρήση νέων τεχνολογιών.
• θα μπορεί να εφαρμόσει τις γνώσεις του για την επίλυση βιολογικών προβλημάτων που θα συμβάλλουν στην κοινωνική πρόοδο.

Γενικές Ικανότητες

• Λήψη αποφάσεων.
• Αυτόνομη εργασία.
• Ομαδική εργασία.
• Παραγωγή της ελεύθερης, δημιουργικής και επαγωγικής σκέψης.
• Εργασία σε διεπιστημονικό περιβάλλον.

Μέθοδοι Διδασκαλίας

• Πρόσωπο με πρόσωπο

Χρήση Τεχνολογιών Πληροφορίας και Επικοινωνιών

• Χρήση Τ.Π.Ε. τόσο στις παραδόσεις των μαθημάτων όσο και στην εργαστηριακή εκπαίδευση με στόχο την πρόκληση διαλόγου με τους φοιτητές και την ανάπτυξη της κριτικής σκέψης τους.
• Υποστήριξη μαθησιακής διαδικασίας μέσω της  ηλεκτρονικής πλατφόρμας e‐class.

Οργάνωση Διδασκαλίας

Αξιολόγηση Φοιτητών

Μέθοδος αξιολόγησης:

• Ερωτήσεις σύντομης απάντησης,
• Εργαστηριακή Εργασία,
• Ερωτήσεις ανάπτυξης.

Συνιστώμενη Βιβλιογραφία

1. ΑνασυνδυασμένοDNA (2010) Συγγραφέας: Watson D.A. κα Εκδοτικός Οίκος: Ακαδημαϊκές εκδόσεις Ι Μπάσδρα & ΣΙΑ ΟΕ ISBN: 978-960-88412-5-3.